| COLLEGE COLETTE - COLLEGE ALTERNATIF DE BESANCON | Besançon | Doubs (25) | Privé | — |
| COLLEGE LES P'TITS NATUROS MONT SOUS VAUDREY | Mont-sous-Vaudrey | Jura (39) | Privé | — |
| COLLEGE PRIVE GRAINE DE VIE | Mesnay | Jura (39) | Privé | — |
| COLLEGE SAINT ANSELME BESANCON | Besançon | Doubs (25) | Privé | — |
| Collège Aigremont | Roulans | Doubs (25) | Public | 107,6 |
| Collège Albert Camus | Besançon | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Albert Jacquard | Lure | Haute-Saône (70) | Public | 101,4 |
| Collège Albert Mathiez | Marnay | Haute-Saône (70) | Public | 111,8 |
| Collège André Boulloche | Bart | Doubs (25) | Public | — |
| Collège André Malraux | Pontarlier | Doubs (25) | Public | 102,1 |
| Collège André Masson | Saint-Loup-sur-Semouse | Haute-Saône (70) | Public | — |
| Collège Aristide Briand | Lons-le-Saunier | Jura (39) | Public | 111,1 |
| Collège Arthur Rimbaud | Belfort | Territoire de Belfort (90) | Public | — |
| Collège Camille Claudel | Montreux-Château | Territoire de Belfort (90) | Public | — |
| Collège Charles Masson | Blamont | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Charles Péguy | Vauvillers | Haute-Saône (70) | Public | — |
| Collège Château Rance | Scey-sur-Saône-et-Saint-Albin | Haute-Saône (70) | Public | 98,7 |
| Collège Claude Girard | Châtillon-le-Duc | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Claude Lorius | Bethoncourt | Doubs (25) | Public | 75,9 |
| Collège Claude Nicolas Ledoux | Dole | Jura (39) | Public | — |
| Collège de Châteaudun | Belfort | Territoire de Belfort (90) | Public | 82,8 |
| Collège de l'Arc | Dole | Jura (39) | Public | — |
| Collège de la Source | Mouthe | Doubs (25) | Public | — |
| Collège des Combelles | Fougerolles-Saint-Valbert | Haute-Saône (70) | Public | 94,1 |
| Collège des Lacs | Clairvaux-les-Lacs | Jura (39) | Public | — |
| Collège des Mille Étangs | Mélisey | Haute-Saône (70) | Public | — |
| Collège des Quatre Terres | Hérimoncourt | Doubs (25) | Public | 92,5 |
| Collège des Thermes | Luxeuil-les-Bains | Haute-Saône (70) | Public | — |
| Collège des Vernaux Marius Daubigney | Tavaux | Jura (39) | Public | — |
| Collège Diderot | Besançon | Doubs (25) | Public | 68,2 |
| Collège du Parc | Bletterans | Jura (39) | Public | 102,7 |
| Collège du Plateau | Lavans-lès-Saint-Claude | Jura (39) | Public | — |
| Collège Duplessis-Deville | Faucogney-et-la-Mer | Haute-Saône (70) | Public | 102,4 |
| Collège Edgar Faure | Valdahon | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Entre Deux Velles | Saône | Doubs (25) | Public | 121,8 |
| Collège Félix Gaffiot | Quingey | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Gaston Ramon | Dampierre-sur-Salon | Haute-Saône (70) | Public | 96,8 |
| Collège Georges Pompidou | Pouilley-les-Vignes | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Gilbert Cousin | Nozeroy | Jura (39) | Public | 103,8 |
| Collège Gustave Eiffel | Fraisans | Jura (39) | Public | 107,2 |
| Collège Guynemer | Montbéliard | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Henri Fertet | Sancey | Doubs (25) | Public | 103,2 |
| Collège Jacques Brel | Vesoul | Haute-Saône (70) | Public | 83,4 |
| Collège Jacques Prevost | Pesmes | Haute-Saône (70) | Public | — |
| Collège Jean Bauhin | Audincourt | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Jean Jacques Rousseau | Voujeaucourt | Doubs (25) | Public | — |
| Collège Jean Jaurès | Saint-Vit | Doubs (25) | Public | 112,2 |
| Collège Jean Jaurès | Damparis | Jura (39) | Public | 102,7 |
| Collège Jean Macé | Vesoul | Haute-Saône (70) | Public | 104,0 |
| Collège Jean Paul Guyot | Mandeure | Doubs (25) | Public | — |