| Collège privé La Passerelle | Oullins-Pierre-Bénite | Privé | — |
| Collège privé La Plume Bleue - Union européenne pour l'enseignement privé musulman | Villefranche-sur-Saône | Privé | — |
| Collège privé Notre Dame Site Claudine Thévenet | Belleville-en-Beaujolais | Privé | — |
| Collège privé Rudolf Steiner | Saint-Genis-Laval | Privé | — |
| Collège Professeur Dargent | Lyon | Public | 107,0 |
| Collège Raoul Dufy | Lyon | Public | 107,8 |
| Collège René Cassin | Corbas | Public | 107,3 |
| Collège Saint-Charles | Rillieux-la-Pape | Privé | 112,4 |
| Collège Saint-Denis | Lyon | Privé | 106,8 |
| Collège Saint-Joseph | Tassin-la-Demi-Lune | Privé | 147,0 |
| Collège Saint-Laurent | Saint-Laurent-de-Chamousset | Privé | 107,5 |
| Collège Saint-Louis - Saint-Bruno | Lyon | Privé | 126,9 |
| Collège Saint-Louis de la Guillotière | Lyon | Privé | 119,8 |
| Collège Saint-Marc | Lyon | Privé | — |
| Collège Saint-Martin | Saint-Martin-en-Haut | Privé | 117,5 |
| Collège Saint-Sébastien | Vaugneray | Privé | — |
| Collège Saint-Thomas d'Aquin | Mornant | Privé | — |
| Collège Saint-Thomas d'Aquin | Saint-Genis-Laval | Privé | 130,3 |
| Collège Saint-Viateur | Amplepuis | Privé | 98,9 |
| Collège Sainte-Marie | La Verpillière | Privé | 132,5 |
| Collège Sainte-Marie | Cours | Privé | — |
| Collège Sainte-Thérèse | Thizy-les-Bourgs | Privé | — |
| Collège Simone Lagrange | Villeurbanne | Public | 77,8 |
| Collège Simone Veil | Saint-Priest | Public | — |
| Collège Simone Veil | Châtillon | Public | — |
| Collège Théodore Monod | Bron | Public | 83,1 |
| Collège Vendôme | Lyon | Public | — |
| Collège Victor Grignard | Lyon | Public | 85,9 |
| Collège Victor Schoelcher | Lyon | Public | 75,1 |
| Collège Élie Vignal | Caluire-et-Cuire | Public | 110,6 |
| Collège Émile Malfroy | Grigny-sur-Rhône | Public | 95,4 |
| Collège Émile Zola | Belleville-en-Beaujolais | Public | 101,5 |
| Collège Évariste Galois | Meyzieu | Public | 102,7 |
| Ecole des enfants intellectuellement précoces de Lyon | Lyon 7e Arrondissement | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Altéressens | Bron | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Bienheureux François de Fatima | Lyon 9e Arrondissement | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Centre de Référence pour l'Evaluation Neuropsychologique de l'Enfant | Lyon 6e Arrondissement | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Collège au carré | Villeurbanne | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Declic | Lyon 8e Arrondissement | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Ecolline | Saint-Martin-en-Haut | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Horizons | Villeurbanne | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Horizons | Craponne | Privé | — |
| Ecole secondaire privée institut de gestion Sociale des Armées | Sathonay-Village | Privé | — |
| Ecole secondaire privée La Fourmi | Lyon 8e Arrondissement | Privé | — |
| Ecole secondaire privée La Maison d'Arqam | Vénissieux | Privé | — |
| Ecole secondaire privée La Péraudière | Montrottier | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Les couleurs de l'aube | Sathonay-Camp | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Montessori'sGones | Lyon 4e Arrondissement | Privé | — |
| Ecole secondaire privée à enseignement spécifique Nescens | Caluire-et-Cuire | Privé | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Aimé Cesaire | Vaulx-en-Velin | Public | — |