| Collège privé la Salle Pringy | Annecy | Privé | 119,8 |
| Collège privé les Tilleuls | Annecy | Privé | 129,8 |
| Collège privé Présentation de Marie | Saint-Julien-en-Genevois | Privé | — |
| Collège privé Sacré-Coeur | Thonon-les-Bains | Privé | — |
| Collège privé Saint-Bruno | Évian-les-Bains | Privé | 125,3 |
| Collège privé Saint-François | Ville-la-Grand | Privé | 120,4 |
| Collège privé Saint-François | Douvaine | Privé | 117,3 |
| Collège privé Saint-François - Les Cordeliers | Annecy | Privé | 116,7 |
| Collège privé Saint-Jean Bosco | Cluses | Privé | 107,1 |
| Collège privé Saint-Jean-Baptiste | Megève | Privé | — |
| Collège privé Saint-Joseph | Sallanches | Privé | — |
| Collège privé Saint-Joseph | Thônes | Privé | — |
| Collège privé Saint-Joseph La Salle | Thonon-les-Bains | Privé | 119,7 |
| Collège privé Saint-Michel | Annecy | Privé | 141,6 |
| Collège privé Saint-Vincent | Collonges-sous-Salève | Privé | 120,5 |
| Collège privé Sainte-Croix des Neiges | Abondance | Privé | 129,7 |
| Collège privé Sainte-Marie | La Roche-sur-Foron | Privé | 126,4 |
| Collège Raoul Blanchard | Annecy | Public | — |
| Collège René Long | Alby-sur-Chéran | Public | — |
| Collège Roger Frison-Roche | Chamonix-Mont-Blanc | Public | 115,1 |
| Collège Samivel | Bonneville | Public | 96,7 |
| Collège Simone Veil | Poisy | Public | 122,3 |
| Collège Théodore Monod | Margencel | Public | 100,9 |
| Collège Val d'Abondance | Abondance | Public | 104,6 |
| Collège Val des Usses | Frangy | Public | 112,1 |
| Collège Émile Allais | Megève | Public | — |
| EBIHS | Annecy | Privé | — |
| Ecole secondaire privée d'Annecy Academy | Annecy | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat ANNE DE GUIGNE | Fillière | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat BRIGHTSIDE ACADEMY | Perrignier | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat des petits kids (EBPK) | Neydens | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat ECLI Montessori | Thonon-les-Bains | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat Espero | Annecy | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat LA VERTU | Annecy | Privé | — |
| Ecole secondaire privée hors contrat SAINTE CECILE | Annecy | Privé | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Arthur Rimbaud | Saint-Julien-en-Genevois | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Champagne | Thonon-les-Bains | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège de Seynod | Annecy | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège de Varens | Passy | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Evire | Annecy | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jean Jacques Gallay | Scionzier | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège K. Ruby St Pierre en Faucigny | Saint-Pierre-en-Faucigny | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Le Clergeon | Rumilly | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Les Allobroges | La Roche-sur-Foron | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Les Rives du Léman | Evian-les-Bains | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Paul Langevin | Ville-la-Grand | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Théodore Monod | Margencel | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté privée La Salle | Annecy | Privé | — |
| Section d'enseignement générale et professionnelle adaptée du Collège Les Justes | Saint-Cergues | Public | — |