| Collège privé Jean XXIII | Mulhouse | Privé | 115,4 |
| Collège privé Jeanne d'Arc | Mulhouse | Privé | 124,3 |
| Collège Privé Mon école et moi | Brunstatt-Didenheim | Privé | — |
| Collège privé Ner Lemosché | Saint-Louis | Privé | — |
| Collège privé Saint-André | Colmar | Privé | 107,0 |
| Collège privé Saint-Jean | Colmar | Privé | 116,0 |
| Collège privé Saint-Joseph | Rouffach | Privé | 115,9 |
| Collège privé Sainte-Marie | Ribeauvillé | Privé | 104,5 |
| Collège privé Sainte-Ursule | Riedisheim | Privé | 123,5 |
| Collège privé épiscopal | Zillisheim | Privé | — |
| Collège René Cassin | Cernay | Public | 103,4 |
| Collège René Schickele | Saint-Louis | Public | 85,9 |
| Collège Robert Beltz | Soultz-Haut-Rhin | Public | 104,8 |
| Collège Robert Schuman | Volgelsheim | Public | 92,8 |
| Collège Robert Schuman | Saint-Amarin | Public | — |
| Collège Rémy Faesch | Thann | Public | — |
| Collège Saint-Exupéry | Mulhouse | Public | — |
| Collège Théodore Monod | Ottmarsheim | Public | 108,2 |
| Collège Victor Hugo | Colmar | Public | — |
| Collège Victor Schoelcher | Ensisheim | Public | — |
| Collège Wolf | Mulhouse | Public | — |
| Collège Émile Zola | Kingersheim | Public | 97,2 |
| Ecole secondaire privée Collège Daniel | Guebwiller | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Mathias Grunewald | Wintzenheim | Privé | — |
| Ecole secondaire privée Waldala | Wittelsheim | Privé | — |
| Etablissement privé International des 3 Frontières (CLG) | Saint-Louis | Privé | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Alice Milliat | Mulhouse | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Bourtzwiller | Mulhouse | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Capitaine Dreyfus | Rixheim | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Charles Walch | Thann | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Gérard de Nerval | Village-Neuf | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Hector Berlioz | Colmar | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Hirsingue | Hirsingue | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jacques Prévert | Wintzenheim | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jean Georges Reber | Sainte-Marie-aux-Mines | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jean Macé | Mulhouse | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Kennedy | Mulhouse | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Les Ménétriers | Ribeauvillé | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Lucien Herr | Altkirch | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Marcel Pagnol | Wittenheim | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Mathias Grunewald | Guebwiller | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Molière | Colmar | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Nonnenbruch | Lutterbach | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Robert Schuman | Volgelsheim | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Saint-Exupéry | Mulhouse | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Victor Schoelcher | Ensisheim | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel du lycée professionnel privé Don Bosco | Wittenheim | Privé | — |