| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège | Saint-Marcel | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Abel Minard | Tonnerre | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Aumenier Michot | La Charité-sur-Loire | Nièvre (58) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Bibracte | Château-Chinon (Ville) | Nièvre (58) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Champs Plaisants | Sens | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Claude Tillier | Cosne-Cours-sur-Loire | Nièvre (58) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Croix Menée | Le Creusot | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Denfert Rochereau | Auxerre | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Fontaine des Ducs | Châtillon-sur-Seine | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du collège Gaston Bachelard | Dijon | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du collège Gaston Roupnel | Dijon | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Georges Brassens | Brazey-en-Plaine | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Guillaume des Autels | Charolles | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Henri Vincenot | Louhans-Châteaurenaud | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Henri Wallon | Varennes-Vauzelles | Nièvre (58) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jacques Prévert | Migennes | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jacques Prévert | Chalon-sur-Saône | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jean Moulin | Montceau-les-Mines | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jean Rostand | Quetigny | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jorge Semprun | Gueugnon | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Jules Ferry | Beaune | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège La croix des Sarrasins | Auxonne | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du collège Le chapitre | Chenôve | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du collège Lentillères | Dijon | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Louise Michel | Chagny | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Maurice Clavel | Avallon | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Maurice Genevoix | Decize | Nièvre (58) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Pasteur | Saint-Rémy | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Paul Bert | Auxerre | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Paul Fort | Is-sur-Tille | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Paul Langevin | Fourchambault | Nièvre (58) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Pierre Larousse | Toucy | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Restif de La Bretonne | Pont-sur-Yonne | Yonne (89) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Robert Schuman | Mâcon | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Saint-Exupéry | Mâcon | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Semur | Semur-en-Auxois | Côte-d’Or (21) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Collège Vallon | Autun | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Section d'enseignement général et professionnel adapté du Lycée professionnel Varzy | Varzy | Nièvre (58) | Public | — |
| SEGPA | Tournus | Saône-et-Loire (71) | Public | — |
| Segpa An. Collège Saint Joseph - La Salle | Dijon | Côte-d’Or (21) | Privé | — |